Vor sieben Jahren verlor Dr. Doolittle, ein berühmter Tierarzt im viktorianischen England, seine Frau. Jetzt lebt er zurückgezogen und versteckt sich hinter den hohen Mauern seines Anwesens. Exotische Tiere aus seiner Sammlung sind seine einzige Firma.

Doch als eine unbekannte Krankheit das Leben der jungen Königin bedroht, muss Dr. Doolittle seinen Unterschlupf verlassen und sich auf eine unglaubliche Reise zur mythischen Insel begeben. Auf der Suche nach einer Medizin für die Königin kämpft er mit gnadenlosen Feinden, trifft auf fremde Kreaturen und muss bemerkenswerten Mut und Einfallsreichtum beweisen.